Dalam Sinode tersebut, ia memberikan penekanan khusus pada “misi kenabian uskup”, sebagai “nabi keadilan”, tugasnya untuk “tanpa henti mengkhotbahkan” doktrin sosial Gereja dan juga “untuk mengungkapkan penilaian yang autentik dalam hal-hal iman dan moral”.
Sementara itu Kardinal Bergoglio menjadi semakin populer di Amerika Latin. Meskipun demikian, ia tidak pernah mengendurkan pendekatannya yang tenang atau gaya hidupnya yang ketat, yang oleh sebagian orang dianggap hampir “asketis”.
Dalam semangat kemiskinan ini, ia menolak untuk diangkat sebagai Presiden Konferensi Waligereja Argentina pada tahun 2002, tetapi tiga tahun kemudian ia terpilih dan kemudian, pada tahun 2008, dikukuhkan kembali untuk mandat tiga tahun berikutnya.
Sementara itu pada bulan April 2005 ia mengambil bagian dalam Konklaf di mana Paus Benediktus XVI terpilih.
Sebagai Uskup Agung Buenos Aires — keuskupan dengan lebih dari tiga juta penduduk — ia menggagas sebuah proyek misi yang didasarkan pada persekutuan dan evangelisasi.
Ia memiliki empat tujuan utama: komunitas yang terbuka dan penuh persaudaraan, kaum awam yang terinformasi memainkan peran utama, upaya evangelisasi yang ditujukan kepada setiap penduduk kota, dan bantuan kepada orang miskin dan orang sakit.
